商丘起源展出了象牙化石、犀牛牙、鹿角及王泊坊、孟庄等古文化遗址出土的历史文物，反映了商丘旧石器时代、新石器时代及商代先民们的社会生产和生活。商丘文化历史博物馆的建筑格局现代而饱含内涵，博物馆的建筑设计构思源于商丘归德古城，表征了古城“外高内低”之布局和“城压城”之结构的典型特征，体现收藏、陈列、展示中国商文化的“微缩之城”这一概念。主体平面设计寓意商丘古城城廓、城湖、砖城三位一体的古城文化元素。主展馆南立面东、西两角上部微微向上翘起，象征一只鸟的两个翅膀，寓意“玄鸟生商”。上、中、下三层错落叠加的形体，喻意商丘古城历史上多座城池早晚依次上下叠压形成的“城压城”的古城特殊的文化遗存现象，也体现着商丘博物馆展厅自下而上、由古至今的陈展布置。